近日,南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)研究员周文良团队与安徽大学教授张保卫团队合作,在珊瑚类生物发光性状演化研究方面取得重要进展。相关成果在线发表于《交叉科学》(iScience)。
生物发光是一种广泛存在的适应性性状,具有捕食、防御和吸引配偶等生态功能。前期研究表明,海洋生物发光系统依赖Ca2+敏感的荧光素结合蛋白(LBP)、荧光素酶(LUC)和绿色荧光蛋白(GFP)三大核心组分。然而,发光性状在不同类群间的系统演化过程尚缺乏系统解析。硬软珊瑚目(Scleralcyonacea)隶属八方珊瑚纲,拥有众多发光类群,广泛分布于从浅海到数千米深海的多个海洋生态位,是研究海洋生物发光演化的理想模式类群。
哈氏仙人掌海鳃基因组组装、系统发育与发光核心基因数量及转录组表达模式。研究团队供图
研究团队首次组装了哈氏仙人掌海鳃(Cavernularia habereri)的高质量染色体级别基因组,基因组大小481.91 Mb,包含14条染色体,Scaffold N50为40.23 Mb,BUSCO完整度达96.1%。在此基础上,对16个硬软珊瑚目物种进行系统发育重建与古海洋环境分析,发现生物发光在这些类群中呈现三次独立起源的演化格局:海笔类群的共同祖先具有发光性状,且起源于2.35亿年前的三叠纪;深海发光物种Paragorgia papillata与Chrysogorgia sp.则约在七千万年前(晚白垩世)独立演化出发光能力,与古海洋环境剧变时期吻合。
比较基因组学和转录组学分析显示,在组成发光系统的LBP、LUC和GFP三大核心基因中,仅LBP呈现出基因扩张,且与发光表型的有无显著关联(p = 0.0019)。然而不同发光支系的LBP基因演化模式各异:海笔类群与Chrysogorgia sp.支系中,LBP具有特有的Cluster 3基因簇,且跨多条染色体分布;而P. papillata发光支系的LBP基因在单条染色体上串联复制,且具有显著的正选择信号(Ka/Ks > 1或 > 0.8)。比较发光物种和非发光物种皮肤转录组基因表达模式,LBP基因在发光类群中呈现显著高表达,而LUC与GFP表达无显著差异。上述结果表明,LBP基因家族的谱系特异性扩张及其后续可能的新功能化,是珊瑚类发光性状演化的重要遗传基础。
该研究初步揭示了珊瑚类发光性状的系统演化与遗传调控机制,为理解海洋动物发光相关生存适应策略提供了新认知。
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.isci.2026.116826
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