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AI设计的编辑器首次在植物中实现高效定向诱变与引导编辑 |
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生成式人工智能的飞速发展,使得基因组编辑核酸酶的“从头设计”成为可能,以OpenCRISPR-1为典型代表,不仅为自然演化形成的CRISPR系统提供了开源备选方案,更有效拓宽了技术应用的自由实施空间。但是,目前该类人工设计编辑系统在植物领域仍缺乏全面系统的功能验证。
近日,美国密苏里大学教授Bing Yang团队联合合作者在《生物技术通报》(aBIOTECH)发表了研究论文。该研究报道了在水稻中开发的、经单子叶植物优化的OpenCRISPR-1基因组编辑生态系统,并对其进行了系统性验证。
通过靶向水稻OsSWEET感病基因家族,研究者证明OpenCRISPR-1在水稻愈伤组织和稳定的T0代植株中均支持高效的多基因靶向编辑(复式编辑),突变频率最高可达100%。深度测序表明,OpenCRISPR-1的突变谱与化脓性链球菌Cas9(SpCas9)高度相似,有利于产生可预测的功能缺失等位基因,从而赋予水稻对白叶枯病的广谱抗性。
为构建完全开源的平台,研究者整合了AI设计的开放骨架sgRNA(OpsgRNA),该骨架在多个靶位点上均能保持极高的编辑效率。此外,通过工程化改造,作者开发了基于OpenCRISPR-1的引导编辑系统OpenPE6c,进一步扩展了该工具箱。在水稻原生质体中,OpenPE6展现出了与经典SpCas9-PE6c相当的精准编辑效率,同时显著减少了非精确副产物的产生,表明这种AI设计的核酸酶具有更高的保真度。
研究结果证实,OpenCRISPR-1是一个功能丰富、性能优异且公开获取的植物基因组高级工程平台,为全球精准作物育种的发展提供了一个透明的框架。
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.abiote.2026.100054
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