近日，记者从中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室获悉，该所海洋牧场构建原理与工程技术团队取得重大科研突破，首次报道海草中的隐存种，相关成果发表于植物学领域国际权威期刊《新植物学家》。

采样分布范围和基于全基因组SNP的种群遗传结构  海洋研究所供图

海草作为沿海生态系统的基石物种，在全球生态系统中发挥着举足轻重的作用。然而，目前全球范围内仅记录有约70个海草物种，如此低的物种数量与其重要的生态功能形成了强烈反差。

研究团队借助大尺度采样与种群基因组学分析，首次发现并证实广泛分布于西北太平洋的日本鳗草内部存在隐存种。这一发现表明全球海草物种多样性可能被严重低估，随着海草种群基因组学研究的持续深入，未来有望在更多海草中发现隐存种，进而为解答海草物种多样性极低这一谜题提供关键线索。

日本鳗草是目前全球少数能够跨越温带与热带—亚热带沿海分布的海草物种。它原本仅分布于西北太平洋，20世纪初，因牡蛎运输活动扩散至北美太平洋沿岸。此前，研究团队运用微卫星等传统分子标记方法，系统评估了全球日本鳗草的种群遗传结构，发现所有种群在遗传上显著分化为南北两个分支，由此推测其内部可能存在隐存种。

为验证这一推测，研究团队开展了一系列严谨的研究工作。他们首先组装了我国南北方日本鳗草两个染色体水平的高质量参考基因组，并对西太平洋地区的17个地理种群进行了全基因组重测序。

种群基因组学分析结果表明，南北两个遗传分支的分化时间约为416万年；相比之下，南方分支与欧洲姐妹种诺氏鳗草的分化时间更短，为267万年。此外，团队利用创新的基因组数据分析方法，在南北分支的接触区发现了少量杂交个体，且这些个体的遗传状态仅表现为第一代杂交后代或三倍体，这为生殖隔离的存在提供了有力证据。

进一步比较基因组学分析揭示，两个遗传分支间存在一个长达42兆碱基对的染色体倒置，且倒置区在两个分支间固定为不同的纯合状态，这可能是生殖隔离形成的重要机制之一。

基于以上发现，研究团队认定当前定义的日本鳗草实际包含两个独立的物种。该研究成果为海草分类与保护策略的制定提供了重要的科学依据。

据悉，中国科学院海洋研究所副研究员张晓梅、德国亥姆霍兹基尔海洋研究中心博士于磊、中国科学院海洋研究所副研究员李玉龙为论文共同第一作者，中国科学院海洋研究所研究员周毅和德国亥姆霍兹基尔海洋研究中心教授Thorsten B. H. Reusch为共同通讯作者。

此项研究工作得到了国家自然科学基金项目、国家重点研发计划、国家科技基础性工作专项等项目的资助。

论文相关信息：

https://doi.org/10.1111/nph.70355