近日，中国农业科学院郑州果树研究所猕猴桃资源与育种团队在《园艺研究》（Horticulture Research）上发表了研究论文，首次揭示了软枣猕猴桃果皮颜色差异形成的三维基因组基础。

红色软枣猕猴桃‘中红贝’。中国农科院郑果所供图

  ?

三维基因组对基因表达调控和生物学性状发生具有重要作用。在真核生物中，染色质高级结构呈现不同层级的功能单位。软枣猕猴桃果皮按颜色主要划分为红色和绿色，目前，三维基因组是否参与软枣猕猴桃果皮颜色调控尚不清楚。

该研究在前期组装首个全红型软枣猕猴桃高质量参考基因组的基础上，利用高通量染色质构象捕获（Hi-C）技术，获得红皮软枣猕猴桃‘中红贝’和绿皮软枣猕猴桃‘中绿贝’的三维基因组数据，比较了染色质高级结构不同层级的差异。

进一步研究揭示了钙调素结合蛋白基因AaCBP60B-like在调控花色苷合成中的功能。该研究为猕猴桃色泽形成提供了表观调控的新见解，也为基因编辑介导的色泽育种提供了新靶点，具有重要的理论意义和应用价值。

郑果所副研究员李玉阔，硕士研究生宋哲、詹栩为论文第一作者，郑果所研究员齐秀娟和方金豹为通讯作者。该研究得到了中国农业科学院郑州果树研究所科技创新工程、国家重点研发计划、国家自然科学基金、国家现代产业技术体系、中国农业科学院科技创新工程等项目资助。

相关论文信息：https://doi.org/10.1093/hr/uhaf183