近日，中国海洋大学水产学院贝类遗传育种团队教授李琪、刘士凯联合英国爱丁堡大学合作者在国际期刊《细胞-报告》发表最新研究成果。该研究首次构建了单倍型解析熊本牡蛎基因组，为双壳贝类遗传育种提供了重要理论基础。

单倍型解析基因组揭示双壳贝类基因组多样性的起源与功能意义  课题组供图

研究团队通过对牡蛎、扇贝、贻贝、珠母贝等代表性物种的跨物种比较分析，发现双壳贝类基因组中普遍存在"单倍型高度分化序列"。这一重要发现揭示了双壳贝类通过维持广泛的个体特异性基因组多样性，形成独特的"群体基因池"，从而在复杂多变的海洋环境中实现高效适应性演化的分子机制。

研究表明，这些单倍型高度分化序列具有双重功能：既能作为新基因的"孵化器"驱动产生创新性遗传元件，又能通过加速保守基因的演化速率，推动关键生理功能的适应性演化。这种独特的基因组演化策略，使双壳贝类既能维持基础生命过程的稳定性，又能快速响应环境压力。研究还通过全基因组演化保守性评估和跨群体时空动态转录组解析，揭示了单倍型多态性驱动等位基因表达的高可塑性。

据悉，该研究成果不仅为理解贝类基因组多样性、表型可塑性与适应性演化的关系提供了新的理论依据，也为突破基因组辅助育种技术瓶颈、创制突破性新品种提供了重要技术支撑，对我国海水养殖产业的可持续发展具有重要意义。

研究得到了国家自然科学基金、山东省重点研发计划、国家重点研发计划和国家现代农业产业技术体系等多个项目的支持。

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https:/doi.org/10.1016/j.celrep.2025.115697