作者:赵婉婷,胡珉琦 来源:中国科学报 发布时间:2025/3/24 17:16:42
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“克星”来了!科学家发现新型抗生素

 

2022年10月,世界卫生组织(WHO)首次发布了重点真菌病原体清单,同时呼吁科研人员加大针对耐药真菌药物的研发。

那一年,王宗强结束了美国的博士后工作,成为中国药科大学多靶标天然药物全国重点实验室的一名教授。

看到这份清单,王宗强心想,巧了,自己关注的问题与WHO的呼吁不谋而合,课题组不就正在进行这类药物的开发吗?

今年3月,王宗强回国后的首项研究正式揭晓了。他与团队联合山东大学药学院尚卓教授,发现了首个靶向真菌细胞膜磷脂的抗生素Mandimycin,为临床治疗耐药真菌感染提供突破性方案。相关研究成果近日发表于《自然》。

提到Mandimycin的杀菌能力,王宗强难掩兴奋:“我们实验后发现,这个药对WHO清单中的19种真菌几乎都有效。” 

王宗强与论文一作、博士研究生邓启森和李银川。受访者供图

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突破“无药可用”的瓶颈

我们生活中常见的真菌感染,例如湿疹和脚气,并不会给健康带来严重的危害。具有致命危险的,是侵袭性真菌感染。这类感染中,病原真菌侵入人体的组织或者血液,或引发身体炎症,或导致组织损伤。

“通常,免疫力低下的肿瘤患者、器官移植患者,尤其是刚做过手术还在ICU的患者,他们患侵袭性真菌感染的风险会非常大”。论文通讯作者王宗强解释,随着各类药物的频繁使用,大量病菌拥有了对抗生素的耐药性,甚至对多种抗生素都‘免疫’了。

所以,患者一旦感染侵袭性的多重耐药真菌,很多情况下无药可用,病死率高达30%至80%。

王宗强告诉《中国科学报》,目前在临床上,用于治疗侵袭性真菌感染的最后一道防线,是两性霉素B,这一1957年研制的高效抗生素。近年,也已有侵袭性真菌产生了对两性霉素B的耐药性。

因此,临床上对于新药的需求十分迫切。

在这样的背景下,王宗强2022年回到了硕博期间的母校中国药科大学,成为抗感染微生物药物课题组的负责人。他要做的,就是发现能抵抗多重耐药真菌的新药。

真菌拥有了多重耐药性,意味着过去抗生素杀菌的“战术”已经不管用了。想要击溃耐药的真菌病原体,就需要挖掘拥有新战术的抗生素。理想中,这样的候选药需要与传统抗生素作用机制不同、有不同的作用靶点。

临床使用的抗生素大多源于微生物的次级代谢物。“然而,好的菌和高效的抗生素已经通过活性筛选技术挖掘得差不多,大家很难再找到全新的抗生素。”王宗强解释。

对于耐药真菌的感染,患者真的无药可用了吗?

面对这样的瓶颈,王宗强提出了“逆向进化理论”,他认为,自然界中的微生物经过了上亿年的竞争与进化,既然耐药真菌广泛存在,那细菌可能也已进化出攻克耐药性真菌的新战术。如果能找到这种用于编码优势抗生素的基因簇,就有望发现新药,在临床对抗耐药性真菌。

基于这样的假设,团队最终从微生物基因组信息中,挖掘并合成了作用机制独特的抗生素Mandimycin。

和传统抗生素“像又不太像”的候选药

关于挖掘、筛选Mandimycin的过程,肯塔基大学药学院的研究人员、《自然》同步上线评论文章的作者Arun Maji这样解释:“研究团队仿佛‘黑’进了全球细菌军事中央指挥部,把20 亿年的细菌文件按时间顺序排列,检索了一个标有‘绝密武器’的文件,其中就包含制造Mandimycin的‘说明书’。”

具体来说,为了寻找具有潜力的抗生素,王宗强团队首先锁定了可能存在“逆向进化”的放线菌。瞄准放线菌是因为,临床上许多具有广谱强效杀菌能力的多烯类抗生素,例如两性霉素B,正是放线菌的次级代谢产物。

下一步,团队自主构建了包含31.6万株微生物基因组数据库。王宗强期待从中看到与编码传统多烯类抗生素“像又不太像”的基因。

什么是像又不太像?王宗强解释,“以它编码的抗生素既要保留多烯类抗生素强效的杀菌‘本色’,又要有独特的作用机制,才可能有抗耐药的效果。”

团队进一步打造了生物信息数据挖掘平台,从178 万条基因簇中,锁定了一条在系统发育树上独特且过去未被发现的进化分支。其中或许就包含合成独特的抗生素的DNA序列。

顺着基因数据找到其对应的放线菌菌种,团队进一步培养出菌种的次级代谢产物。就这样,多烯类家族中诞生了一个新的抗生素,Mandimycin。

王宗强解释,传统多烯类抗生素的杀菌“战术”是,通过靶向真菌的麦角甾醇杀死病原菌。出乎意料的是,Mandimycin只靶向真菌细胞膜结构的主要成分,磷脂。

而这是一种过去闻所未闻的靶向机制。

团队发现,Mandimycin与病原菌的磷脂结合后,会导致细胞膜渗透性增大,细胞的重要离子(如钾离子)就会外排,最终使得病原菌细胞塌陷、死亡。

这样一来,在病原菌对靶向麦角甾醇的传统战术免疫的情况下,靶向磷脂分子的Mandimycin就能出奇制胜。

Mandimycin与真菌细胞膜磷脂分子结合示意图。受访者供图

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王宗强透露,“不光我们很惊讶,审稿人都不相信,多烯类抗生素向来与麦角甾醇结合,Mandimycin怎么会是个例外?还让我们通过更多实验去验证、解释。我们也确实交出了让审稿人信服的实验结果。”

原来,一个特殊的分子结构是关键。

团队进一步探究发现,与已知多烯类抗生素相比,Mandimycin多出两个糖基配体。在被敲除双糖基配体后,不完整的Mandimycin露出了“本色”,和家族中其他抗生素一样仅与麦角甾醇结合。重新加上糖基配体后,Mandimycin又转回特异性靶向磷脂的战术。

Mandimycin与家族中其他抗生素“像又不太像”,这完美符合王宗强的期待。

继续挖掘耐药菌的“克星”

Mandimycin的横空出世,打破了人们近60年对于多烯类抗生素靶向机制的认知。那么,Mandimycin的具体效果怎么样,可以给治疗耐药真菌的侵袭性感染带来希望吗?

为检验Mandimycin的杀菌能力,团队建立了多种小鼠感染模型,包括全身、软组织和皮肤相关感染,以及体外感染模型。

动物实验结果表明,Mandimycin 对于众多病原菌都有极强的杀伤力。无论是WHO 清单中的念珠菌、新型隐球菌、曲霉菌等,还是其他对唑类、棘白菌素、两性霉素B抗生素耐药的病原菌,Mandimycin都可谓是它们的“克星”。

当然,一个新的抗生素想要投入临床使用,仅有强效广谱的杀菌能力可不够,还需要通过一系列毒理测试、有好的成药性。

王宗强表示,在相同实验条件下,Mandimycin带来的肾毒性和溶血性较两性霉素B显著降低。

此外,令他惊喜的是,Mandimycin的水溶性极高,是两性霉素B的9700倍。“这意味着,无论是口服还是静脉注射,Mandimycin的起效都会很迅速。”

审稿人也毫不吝啬称赞:“这个新颖的候选药是令人振奋的,未来将对侵袭性真菌感染的病人发挥重要作用。”

下一步,团队会继续深入探究Mandimycin与磷脂分子结合模型以及其选择性,全面评估临床安全性与有效性。

王宗强期待在不远的将来,这一具有潜力的候选药能实现治疗患者的使命。“现在,Mandimycin中文名叫做曼迪霉素。等它走到临床使用那一步,也会拥有一个商品名。”

团队利用系统发育指导的天然产物发现策略,基于“逆向进化”理论突破新药物发现的瓶颈,给了王宗强极大地鼓舞。他相信,微生物中还有许多尚未被挖掘的、可以用于合成抗生素的未知成分。

在取得阶段性成果的同时,团队没有停下探索未知的脚步。

他们启动了全球药用放线菌的分离测序计划,希望通过国际合作,从全球不同地方收集更多放线菌土壤样本,利用生物信息学技术,进一步挖掘微生物中有药用价值的“暗物质”,继续寻找致死率高耐药菌的“克星”。

相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41586-025-08678-9

 
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