作者:郑金武 来源:中国科学报 发布时间:2020/6/4 15:29:34
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新方法提高基因遗传位点的识别能力和准确性

 

近日,内布拉斯加州林肯大学Chenyong Miao和鲍林格林州立大学Yuhang Xu联合研究团队创新了一种方法,成功地鉴定了高粱全基因组中的已知和特征基因。相关成果发表在《植物生理学》杂志。

植物的表型随着时间的推移而发展,并随着环境的变化而变化。在不同的时间和环境中,植物的表型受到不同基因组的调控。随着新的工程和计算机视觉技术的发展,使得跟踪这些植物表型的变化取得了巨大进步。

但是,识别调控表型变化模式差异的遗传位点仍然是一个挑战。在该研究中,联合团队采用功能主成分分析法(FPCA)来识别高粱全基因组中调控表型变化的遗传位点。

实验中,联合团队利用包括高光谱成像在内的多种技术,持续37天观察和收集了高粱的时间序列表型数据,并成功鉴定出了一些已知的控制高粱性状变异的基因,并划分了这些基因在控制表型中的作用。

进一步研发显示,这些分离结果与克隆基因的已知分子功能一致。

这些数据表明,基于FPCA的全基因组关联研究,能够在广泛的背景下进行稳健的时间序列映射分析,进而鉴定遗传位点,并提高定量遗传分析的准确性和能力。

相关论文信息:DOI:10.1104/pp.20.00277

 
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