作者:冯丽妃 来源:中国科学报 发布时间:2020/5/27 14:31:42
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蝙蝠体内发现新冠病毒“近亲”
为研究病毒自然演化提供新证

 

新冠肺炎的元凶新冠病毒到底来自何处?社会各界都对这个问题争论不休。虽然科学界普遍认为新冠病毒的宿主最可能是蝙蝠,但它的起源仍是个谜团。

山东第一医科大学病原生物学研究所所长史卫峰、中国科学院微生物所病毒传播预警与致病机制研究组长毕玉海等,在蝙蝠身上新发现了一种冠状病毒RmYN02,经分析,它基因组中的某些区域与新冠病毒关系极为接近,而它的刺突蛋白(S蛋白)的S1、S2亚基连接处也存在氨基酸插入,插入的方式也和新冠病毒非常相似。因此,虽然这种新病毒并非新冠病毒演化上的直系始祖,但也可以从中看出:S蛋白中这种插入现象看似反常,但也可以是冠状病毒演化的自然结果。相关研究近日发表于《当代生物学》。

“自从新冠病毒进入人们的视野,所谓‘病毒来自实验室’这种毫无根据的说法便甚嚣尘上,尤其是有人声称S1/S2插入的情况非常罕见,怀疑它是实验室操作的结果。”研究通讯作者史卫峰表示,“而我们研究的结果明确揭示,这种插入现象能够在野生动物的身上自然发生,这无疑是反驳‘实验室泄漏’谬论的强有力的证据。”

史卫峰团队分析了2019年5月至10月在云南省采集的227个蝙蝠样本,从中发现了新病毒RmYN02。史卫峰解释道:“自从2005年发现蝙蝠是SARS冠状病毒的宿主以来,科学界对蝙蝠携带传染病原体的研究一直热度不减,蝙蝠体内包括冠状病毒在内的RNA病毒种类丰富的现象尤其引人注目。”就在新冠病毒被发现后不久,2020年1月初,这些蝙蝠样本中采集到的RNA被送往实验室,进行宏基因组学下一代测序。

从全基因组的角度上来看,与新冠病毒亲缘关系最近的是此前从云南省蝙蝠体内分离出的病毒RaTG13,而本研究中新发现的病毒RmYN02则是在基因组的某些部分与新冠病毒有更密切的关系,这些部分包括整个基因组中最长的编码区1ab,两种病毒该区域的RNA重合度达到97.2%。不过研究人员指出,新冠病毒的基因组中有一段用于编码与人ACE2受体结合的关键受体结合结构域,有利于其感染人体宿主细胞;而RmYN02病毒的这一段编码区与新冠病毒相似性较低,所以它感染人体的可能性并不大。

RmYN02与新冠病毒最关键的相似之处在于,它的刺突蛋白(S蛋白)的两个亚基连接处也存在氨基酸插入现象。此前对新冠病毒的研究发现它刺突蛋白的S1、S2的连接处插入了4个氨基酸,这个现象是其独有的,而且普遍存在于迄今为止测序过的所有新冠病毒病毒之中。而RmYN02病毒中的插入现象与新冠病毒不同,这表明两者的插入事件是互相独立的。此次在蝙蝠体内发现另一种病毒也存在类似的插入现象,这强烈表明这种现象是自然条件下发生的。“这项研究证明,此类插入现象虽然起初看上去很不寻常,但其实完全可能源于动物β冠状病毒的自然变异。”史卫峰说。

史卫峰还指出:“本次研究为我们探索新冠病毒的演化学起源提供了更多线索。RaTG13和RmYN02都不是新冠病毒的直接祖先,因为这两种病毒与新冠病毒仍有很大的演化学差异。但此次我们的研究结果至少明确地证实了这一点:要找出与新冠病毒关系更为密切的病毒,乃至揪出其直系祖先,最有希望的途径还是扩大对野生动物物种的采样分析,这样我们才能更深入地了解这种病毒究竟是如何传到人类的。

相关论文信息:http://doi.org/10.1016/j.cub.2020.05.023

 
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