作者:赵熙熙 来源:中国科学报 发布时间:2012-2-10 14:01:01
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德科学家义举:序列上网免费下载

 
西伯利亚的丹尼索瓦洞。图片来源:Ann Gibbons
 
德国研究人员于2月7日在马普学会进化人类学研究所网站上贴出了一个灭绝人类基因组的首个高分辨率版本。他们的目标就是让同行能够免费下载最完整的序列数据。
 
1年前,研究人员公布了至少3万年前生活在西伯利亚丹尼索瓦洞中的一名史前女孩的首张基因组草图。
 
今年1月,马普学会的古基因学家Svante Paabo在瑞典参加一次会议时注意到,其他实验室的研究人员还在关注这个1年前发布的序列数据,而与他的同事在实验室用更灵敏的新方法对序列的古DNA进行分析后得出的结果相比,前者远不是那么完整。Paabo说:“在得知我们已经拥有了相同基因组的更佳版本,并且他们要再过几个月才能够使用时,我感到很难受。”
 
因此,Paabo及其同事决定允许他们的同行下载该序列数据的高分辨率版本——尽管他们正在准备发表一篇有关该基因组研究的论文。利用从史前女孩的手指骨中提取的不足10毫克的DNA,研究小组如今对其基因组每一点的测序平均精确了30倍。研究人员曾在2010年12月的《自然》杂志上报告说,与1.9倍的覆盖相比,这种30倍的覆盖能够提供更多的细节信息。
 
更高的分辨率意味着Paabo及其同事如今能够对比史前女孩遗传自父母的基因副本中较小的差异,同时搞清她的DNA与现代人和尼安德特人之间到底有哪些不同。与现代人相比,史前女孩更接近于尼安德特人,但她的基因组并不在迄今为止发现的尼安德特人的变异范围之内。
 
尼安德特人、丹尼索瓦人和现代人都曾同时生活在亚洲大陆,但混种的程度很低;生活在美拉尼西亚及亚洲其他部分的现代人仅继承了4%的丹尼索瓦人基因组。
 
(赵熙熙 译自www.science.com,2月8日)
 
《中国科学报》 (2012-02-09 A2 国际)
 
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