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作者:杜亮 来源:科学新闻杂志 发布时间:2008-6-26 0:26:29
《PLoS生物学》2008年6卷4期
小小芯片演绎达尔文进化论

 

达尔文的《物种起源》即将迎来150周年纪念。长期以来,基于达尔文进化理论的重要性,人们期望能在实验室重现达尔文进化现象(比如在试管中进行分子反应等),从而更快更好地理解自然界的进化,但是往往由于操作费时费力而难以达到实验目的。令人惊喜的是,最近美国科学家利用一张小小的芯片,在分子水平上成功显示出达尔文进化中自然进化现象。
 
来自美国斯克利普斯研究院的研究人员设计了一套实验系统,结合运用计算机自动化控制技术和微流控芯片技术,检测RNA类酶的进化特征。研究中使用的RNA类酶是I类RNA连接酶的子代,它可以将含有启动子的寡核苷酸底物连接到自己身上。在反应体系中同时有逆转录酶和T7 RNA聚合酶。反应初始,通过随机突变(易错PCR)得到众多RNA类酶的突变体。这些RNA类酶突变体混合物和底物(含有启动子的寡核苷酸链)通过微流控技术混合,随后连接底物的RNA类酶在一定条件下进行自我扩增。当扩增到一定数目时,将反应产物的1/10分离出来,再进行随机突变,并将产物继续与逐步降低浓度的底物混合、反应。不断重复至数百次,在这个过程中,随着RNA类酶突变位点的积累,那些最能有效和底物连接的RNA类酶突变体在产物“群体”中占据主导地位并最终被保留下来。
 
最后,研究结果获得的一种RNA类酶的突变体累积了11个突变点,在固定条件控制(选择压力)下其底物利用率上升了90倍。这类RNA类酶的进化几乎完美地再现了达尔文的自然进化现象,结合计算机和微流控技术,在小小的芯片上演绎达尔文进化理论将不是难事。
 
原文链接:http://biology.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pbio.0060085 (杜亮/编译)
 
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