| 《基因组学》2008年91卷3期 |
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| 真核基因组中邻近基因的共表达及共调控 |
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同紧密相连和高度组织化的原核基因组不同,真核基因组相对来说很混乱。人们通常认为,除了一些由于基因复制形成的保守基因簇之外,真核基因很随机地分散在基因组中,相对邻近的基因独立表达。然而,越来越多的证据表明,除了独立控制的启动子序列和特异的转录因子之外,真核基因的表达调控同样也依赖于其在基因组中的位置。首先,转基因的表达类型多样化是由于其插入的位点不同引起的;第二,在酵母中,相邻的复制基因表现出相似的表达类型;第三,许多生物的全基因组的表达研究,例如果蝇、线虫、小鼠和人类等,都可以看出有相似表达水平的基因不是随机分布在基因组中的,而是趋向于在相同基因组邻近位置中成簇聚集。
这种相邻之间基因共表达的情况,能够从多样的生物化学、遗传学和进化学等当面来解释。基因组中的重叠基因、随机复制基因、同源基因和操纵子在一定情况下可以用来解释共表达,但是不能够解释所有的共表达类型。因此,假设相邻基因染色质区,当基因表达的时候,染色质打开,同时使相邻的基因也表达。
所以说基因共表达簇是真核基因组固有的一部分,并不是统计学的结果,将来的研究会更多得益于统一框架的发展和用于检测共表达簇定量方法的细化。
原文链接:http://www.sciencedirect.com/science/journal/08887543(周媛媛/编译)