作者:徐徐 来源:中国科学报 发布时间:2018/8/13 10:16:01
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再现高影响力癌症论文计划遇阻

图片来源:DAVIDE BONAZZI

一个在近5年前设立的雄心勃勃的项目,就目前来看或许只能完成18项研究。该项目旨在重现来自50篇高影响力癌症生物学论文的试验,但该数字正不断缩减。

“我希望我们能做得更多。”在美国弗吉尼亚州开放科学中心管理该项目的生物学家Tim Errington说。但他同时表示,“很多时候只有你真正开展这类项目,才能理解它多么具有挑战性。”

在两家药物公司报告称它们在重现很多癌症研究时遇到麻烦后,作为一项测试可现性的开放努力,“重现性项目:癌症生物学”于2013年10月启动了。此项工作由总部位于加州帕洛阿尔托的“科学交流”公司合作进行。该公司寻找签约实验室,以重现一些来自论文的关键试验。资助包括来自劳拉·阿诺德基金会的130万美元经费——足够每项研究花费2.5万美元。试验预计持续1年。

该项目很快招致初始研究作者的批评。还有人担心,这些可现性研究将不可避免地失败,因为签约实验室缺少再现研究工作的经验。

随着组织者意识到他们需要更多来自初始作者的信息和材料,成本开始上升,延期也接踵而至。一项让被提议的重现工作接受同行评议的决定也拖延了时间。组织者在2015年底将论文清单缩减至37篇,然后在2017年1月将其缩至29篇。Errington介绍说,在过去的几个月里,他们决定终止正在进行的38%(11篇)的重现工作。

Errington表示,砍掉部分重现工作的一个原因是优化试验以获得有意义结果所花费的时间太长。例如,为确定一项试验的细胞密度,需要测试一系列细胞密度。尽管“这些事情在实验室中自然地发生”,但如果方法论上的细节被包括进初始论文,再现工作可能会进行得快一些。该项目还花费大量时间获得或者重新标记诸如细胞系和质粒等无法从初始实验室获得的试剂。

此项工作带来的一个教训是:披露更多实验报告细节并且制造可直接从初始实验室免费获得或者通过第三方公司购买的材料,将强化科学家以其他人的工作为基础开展研究的能力。“交流和共享是很容易摘到的果子。我们可以在这方面努力改进。”Errington说。(徐徐

《中国科学报》 (2018-08-13 第3版 国际)
 
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